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与患者合作的研究发现了罕见癌症的遗传根源的线索

麻省理工学院和哈佛大学,达纳-法伯癌症研究所和Count Me In的科学家与患者密切合作,发现了罕见血管壁癌的新病因,称为血管肉瘤。该研究还指出了对于这种侵袭性疾病患者的治疗选择,这些患者通常预后较差。

该研究是血管肉瘤项目的结果,该项目是患者与科学家之间的独特合作关系,它使患者能够贡献自己的病历,生物样本和声音来加速研究。这项工作还表明,由人群分散的努力将一小群分散的患者团结在一起,可以产生关于这种疾病的意想不到的发现,因为这种疾病非常罕见,因此难以研究。

在发表于《自然医学》上的这项研究中,研究人员分析了来自美国和加拿大的血管肉瘤患者捐赠的近50个肿瘤样本的基因组。该小组发现了数十种不同形式的癌症中的突变基因,以及线索表明,被批准用于其他类型癌症的药物可能对治疗某些类型的血管肉瘤有用。

“这项工作只有在我们的患者合作伙伴的帮助下才能实现,”资深作者尼古拉·瓦格(Nikhil Wagle)说。“他们所帮助产生的科学见解为人们对血管肉瘤根源的了解不清提供了新的思路,因此迫切需要为患者提供新的治疗选择。”

“当我们第一次看到这些数据时,我们很高兴看到从一开始就从基因组数据中发现了这些发现,”第一作者,广泛癌症计划运营和科学推广副总监Corrie Painter说。以及Count Me In的副总监。“从一开始就与患者一起设计和构建项目是一种了不起的经验。” Painter是一名科学家,在2010年自己诊断出血管肉瘤后就成为患者的拥护者。

病人伙伴

血管肉瘤项目于2017年启动,是Count Me In的一部分,该项目旨在通过直接让癌症患者在线参与到生物医学研究中来催化几种癌症类型的研究,无论他们住在美国或加拿大的何处。Count Me In建立在最初努力的成功基础上,即转移性乳腺癌(MBC)项目,该项目也带来了许多发现。血管肉瘤项目旨在在罕见疾病的背景下评估这种患者伙伴关系模型,在这种情况下,迫切需要进行研究以改善患者预后。

血管肉瘤出现在内皮细胞中,内皮细胞形成血管的内壁,可以发生在人体的任何地方,但最常见于皮肤,乳房,肝脏和脾脏。这是一种极为罕见的癌症,在美国每年只有300例新病例,预后通常很差。患者分散在全国各地,因此到目前为止,进行大规模研究以发现疾病的分子基础尚不可行。

ASCproject团队建立了一个社交媒体工作组,以在线联系患者与血管肉瘤和亲人,并邀请他们帮助制定该项目的推广策略。在患者合作伙伴的反馈下,该团队在ascproject.org上建立了一个在线门户网站,该门户网站允许美国和加拿大的患者加入研究,并贡献其病史和肿瘤或血液样本进行DNA测试。在启动ASC项目的18个月内,有338名患者登记,占美国所有血管肉瘤患者的很大比例。

在患者同意的情况下,项目人员从部分注册患者中获得了病历和肿瘤样本。Broad的基因组学平台对来自这些患者的47个肿瘤样品的外显子组或蛋白质编码区以及来自同一患者的种系(遗传)DNA进行了测序。Wagle实验室的计算生物学家之一,共同第一作者Esha Jain领导了数据分析,揭示了30个经常在几种肿瘤中突变的基因。其中一些基因从未与血管肉瘤相关,例如PIK3CA,GRIN2A和NOTCH2。

潜在的治疗选择

PIK3CA突变的大多数样品是乳腺血管肉瘤。研究人员研究了基因本身突变的位置,并推断它们很可能是“激活”突变,这意味着它们使蛋白质具有新功能或增强功能。这表明用FDA批准的称为PI3激酶抑制剂的药物阻断PIK3CA途径可能对携带这些突变之一的乳腺血管肉瘤患者有所帮助。

PIK3CA基因也在乳腺腺癌中发生突变,这是恰好发生在同一组织中的另一种类型的癌症,这表明有关乳腺细胞环境的某些现象会促使这些肿瘤发展。

Painter说:“这样的发现确实可以为我们在组织特异性背景下思考基因的方式打开大门。” 如果没有这些数据,我们永远不会拥有这种见识。”

该小组测量了肿瘤的总体突变率,并了解到头,颈部,面部和头皮(HNFS)的血管肉瘤比其他肿瘤具有更高的突变负担。这些突变的模式以前与紫外线辐射造成的伤害有关,这表明阳光的伤害可能导致了这些患者的疾病。

由于其他突变过多的肿瘤已经对使用称为免疫检查点抑制剂(ICI)的药物产生了反应,因此研究人员推测这些药物可能对HNFS患者有所帮助。实际上,他们在研究中发现了两名患有HNFS血管肉瘤的患者,他们对标准治疗无效后,给予了标签外ICI,并且对治疗的反应特别好。尽管由于副作用需要中止治疗,但这些患者今天仍然没有疾病,无需对其癌症进行任何进一步的治疗。这表明ICI可能会帮助某些患有这种亚型的患者。

影响越来越大

需要更多的工作来证明这些非标准疗法对患者是否有效,但是这些发现促进了血管肉瘤的研究。由于这项研究中的数据,目前正在进行至少三项临床研究,其中包括血管肉瘤患者,该数据在发表前已与科学和医学界共享。

ASCproject继续招募患者并分析数据,现已有近500名注册患者。画家说:“这是一个令人鼓舞的目标,老实说,我不知道我们是否会实现,更不用说在两年半内实现。”

吉姆·查普德莱因(Jim Chapdelaine)是吉他手兼康涅狄格州哈特福德市艾美奖获奖唱片音乐家,于1976年首次被诊断出患有血管肉瘤。他希望参加这项研究,以期他作为一个特别长寿的幸存者的经历可能有助于使其他患者受益。他说:“得知我和患者社区的其他人为这些新发现提供了动力,真是令人惊讶。” “我希望有一天能治愈,但是这项研究有助于打开科学的大门,我们希望人们现在能够通过它。”

画家解释说,新发现令人鼓舞,但也有喜有忧,因为她记得在血管肉瘤社区中没有幸存下来的朋友。她说:“ ​​ASC项目的参与者已经签署,希望这将对人们有所帮助。” “我们很高兴在他们自己的诊断中,他们希望尽自己的一份力量来帮助防止其他患者的痛苦。”

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