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高度敏感的表观基因组技术与疾病作斗争

关于疾病以及我们的身体对疾病的反应方式,仍然知之甚少,部分原因是人类基因组是使每个人都独一无二的完整DNA组装体。弗吉尼亚理工大学的一位教授和他的研究人员团队创造了新技术,以帮助了解人体如何抵抗疾病。

在最近发表的《自然规约》中的文章中,弗吉尼亚理工大学化学工程专业的Fred W. Bull教授Chang Lu以及化学工程专业的学生Bohan Zhu和Yuan-Pang Hsieh一起,描述了他们正在研究微流体技术的微流体技术。从乳腺癌和脑癌到精神分裂症和成瘾的疾病。

陆说:“由于缺乏先进和精确的技术,经过多年的研究,许多疾病的分子基础仍然难以捉摸,这让我们感到鼓舞。”

开发的新技术包括有关设备制造,设置和操作的详细说明,该技术基于微流体振荡洗涤的染色质免疫沉淀,随后是称为MOWChIP-seq的测序方法,该方法是一种低输入技术,使用最少100个细胞即可表征表观基因组。

该方法是新颖的,因为到目前为止,常规方法每次测定都需要数千万个细胞。但是,通过使用这种新的测序方法,该团队发现他们可以使用每个测定少至100个细胞,一次运行即可完成多达8个测定,从而生成组蛋白修饰图。

Lu说:“通过比较正常和患病的表观基因组,可以发现有用的标记和模式,并将其用于基于个体患者表观基因组特征的精密医学。”

这项研究基于Lu先前在开发MOWChIP-seq方面的工作,该论文于2015年在《自然方法》杂志上 首次发表。Lu 和他的前博士生曹振宁因其工作而获得了美国专利。与2015年的原始出版物相比,Lu和他的团队在当前方案中详细介绍了他们最近在自动化MOWChIP-seq过程和一次运行并行处理八个样本方面的工作。

团队的流程是半自动化的,可减少人工并提高可重复性,并且具有可扩展性。

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